贾湖骨笛的出土，彻底改变了中国音乐历史起源的文献和传说的观点。《吕氏春秋》对古乐的起源曾有论述：“昔黄帝令伶伦作为律。伶伦自大夏之西，乃之阮隃之阴，取竹於嶰溪之谷，以生空窍厚钧者，断两节间－－其长三寸九分－－而吹之，以为黄钟之宫，---帝喾命咸黑作为声，歌九招、六列、六英。有倕作为鼙、鼓、钟、磬、吹苓、管、埙、篪、鼗、椎、锺。---帝尧立，乃命质为乐，质乃效山林溪谷之音以歌--” 黄帝之时，伶伦断竹而吹之，而创始乐律。帝喾之时，倕作为鼙、鼓、钟、磬、吹苓、管等多种乐器，帝尧命质仿效山林溪谷之音为乐等，之后，人们总是将中国音乐起源历史与三皇五帝的创造活动相联系。而距今八千多年的贾湖骨笛，将中国音乐的源头，一下推前了数千年。
近代音乐史学家，还在孜孜以求地讨论，中国的七声音阶最早出现的时间，甚至认为战国末年荆轲刺秦皇，在易水别离所唱的“风萧萧兮易水寒”用的“变徵”之音，是来否来自于西方异域，而近年来络绎不绝的音乐考古发现，完全推翻了这类观点。8700年前，我们的祖先已经用骨笛吹出了近七声的下徵调乐音。时间六千年一瞬间，而曾侯乙编钟又以其5个八度音域，完整的七声与十二律、十二个半音系统，和声和各种音程概念、八度音组概念等，应有尽有集大成的乐律学说，成为我们今天宝贵的文化遗产。同样，贾湖骨笛以考古学实证的方法，科学地诠释了中国远古时期音乐之初始的活态面貌。
自1983年始发掘出土的近30支骨笛中，近三分之一为较完整的器物，而通过测音的大约有七支，此后的十余年中，黄翔鹏、吴钊、童忠良、萧兴华等音乐学专家都曾对贾湖骨笛作了测音研究，初步揭示了贾湖骨笛原始音乐性能；郑祖襄、陈其射、项阳、陈其翔、荣政等学者对测音数据、音阶音程和调高等相关问题的论证分析；徐飞、王昌燧等人，对新出土骨笛音乐声学特性的新探索等。近来已经有学者开始致力于科学技术手段逼真复原骨笛，以获得更多的骨笛音响信息。
首先，作为一种最早的、完整的管乐器，我们最先要知道的是它如何奏出乐音，目前贾湖骨笛演奏方法，需要深入地再认识。究竟骨笛是应该如何发声的。1989年，黄翔鹏先生提出的斜吹法发声，刘正国先生在此基础上对斜吹法进一步研究，认为斜吹可以更好地使气流摩擦震荡管壁发音，具有厚重的原始感。刘先生在演奏测试实践中证实，斜吹法则可发出非常清晰悦耳的乐音，并可轻松演奏出两个八度，这是竖吹法难以实现的。虽然在实际测音方式中，《舞阳贾湖》考古报告中的测音结果，似多以竖吹法获得，发布在英国《自然》杂志网站上的骨笛音乐，也是竖吹法的演奏录音。
从古代中国直到今天的哈萨克斯坦以及中国新疆等地，一直不乏采用斜吹法的原始形态乐器如鹰骨笛等，特别是至今还流传于中原的道教音乐中的乐器“筹”，乐器的形制和骨笛非常相似。这种古老的斜吹演奏方式，可使两端开口的笛管发出坚实悦耳的音声。
其次是对考古出土贾湖骨笛的测音研究。1989年黄翔鹏先生对保存完整地M282：20号骨笛的测音后，提出的结论是测音骨笛的音阶结构至少是六声音阶，也有可能是七声齐备的、古老的下徵调音阶。吴钊先生则认为其中有些音程的音分值较接近三分损益律或纯律。童忠良先生根据结合对另外两支骨笛(M282：21，M78：1)的音孔设计特点，认为构成以4孔(D)为宫的六声清商音阶或七声清商音阶可能性最大。下列是黄翔鹏先生根据对M282：20号骨笛的测音所排出的音阶：
在音乐起源的初始阶段，人们对音阶和调高的认识是有限的，但我们不能低估史前先民对乐音的感知水平和创造能力，他们所处的自然环境更多和谐的天籁之声。影响骨笛乐音的音高调式会有很多因素，我们从河南省文物考古研究所在《舞阳贾湖》考古报告中所公布的数据中可以见出，人们对乐音和音阶的感知，经历了由少到多，循序渐进过程。
学者对2001年新出土的M511：4七孔骨笛测音数据可见，可以完整演奏两组八度的音列，和今日十二平均律相比，各音孔最大音差也仅在25音分左右。音乐学学者通过对7支骨笛测音数据的分析研究认为它们存在三种调和四种音阶。三种调高是：“C”、“D”(或“﹟D”)、和“A”(或“﹟A”)；四种音阶是：“四声音阶”、“五声音阶”、“燕乐六声音阶”和“清乐六声音阶”。而目前贾湖遗址揭露发掘面积仅在遗址总面积的二十分之一，对贾湖骨笛所蕴藏的音乐之谜，还有待更进一步的发现和更深入的研究。
舞阳贾湖骨笛的学术价值，已远远超出它的地域范围，在整个世界音乐史起源的物证中，贾湖骨笛无论在科学实证、年代的可靠性方面，还是在音乐艺术成就方面，都是无与伦比的。中华民族的音乐文化，中原民族的音乐水平，在史前时期已远远走在世界的前列。
图三 舞阳贾湖骨笛复原演奏
音乐贯穿人类文明进化的始终, 音乐起源必将伴随人类文明起源的破解而水落石出。
大自然的生命本旨，是在成长和消亡中发出自己的声音，这些声音关乎对自然的爱与敬畏，对逝去美好的追忆，对神灵的崇尚，对生与死、爱与恨的感悟，这一切在人类心灵中，是用最本真的和所能创造出来最美好的声音来述说的，这种美好的声音就是音乐。